В 1992 году окончил Дагестанский государственный медицинский институт, клиническую ординатуру на кафедре детской хирургии окончил во 2-м Московском государственном медицинском институте им. Н. И. Пирогова (ныне Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова). В 1997 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Лечение ожогов и рубцовых стенозов глотки и шейного отдела пищевода у детей». В 2002 году защитил докторскую диссертацию на тему «Реконструктивные операции при стенозах глотки и пищевода у детей». Стаж работы по специальности 25 лет, имеет высшую квалификационную категорию по детской хирургии. Специализируется в области реконструктивно-пластической хирургии органов шеи и грудной полости, эндохирургии.

С. М. Батаев ведет активную научную работу, по результатам которой опубликовано 240 статей в отечественной и зарубежной печати. Неоднократно выезжал на стажировки в ведущие клиники мира, в том числе Ludwig Maximilians University Нospital (Мюнхен); The Great Ormond Street Hospital for Children NHS Trust (Лондон); University College Института им. Президента Нассера (Каир) (Египет); Universitats Kinderklinik –LKH-Graz (Грац). Член Российской ассоциации детских хирургов, ассоциации хирургов Москвы и Московской области, Европейской ассоциации детских хирургов (EUPSA).

Лауреат Премии Правительства Российской Федерации (2000 г.); Bill Marshall Memorial Foundation Award in Paediatric Surgery (1998 г.); Премии Российского Государственного медицинского университета «За лучшую научно-исследовательскую работу (1999, 2000 гг.) и ряда других.

Срок действия аккредитации: по специальности "Торакальная хирургия" до 27.12.2026 г.

Срок действия сертификата: по специальности "Детская хирургия" до 11.11.2025 г.